Moi j'te conseille plutôt ça :
http://khayyam.developpez.com/articles/cpp/tinyxml/

t'en chieras moins niveau documentation, et c'est très haut niveau aussi.

Rapport à tes questions, une simple recherche google t'aurait suffi pour trouver le problème que pose ce genre d'opérations :
http://forum.hardware.fr/hfr/Programmation/C-2/compter-repertoire-linux-sujet_23838_1.htm --> Linux
http://forum.hardware.fr/hfr/Programmation/C-2/explorer-repertoire-sujet_22819_1.htm --> Windows

La portabilité de ton programme va sans doute en prendre un coup =/