A partir de IRRlicht 1.7.1 (mon essais à partir de cette version, on peut le faire)
Tu doit avoir 1 "skinnedmesh" pour ton modèle et un autre skinnedmesh pour ton animation (tu sauve seulement l'animation avec ton exporter)
J'ai testé avec le format .b3d et .x et ça fonctionne très bien.

1 - Tu charge tes fichier avec les commandes "getMesh()"
2 - Tu doit ensuite spécifier à IRRlicht que tu veut prendre l'animation dans un autre meshfile..

Exemple:

     // Créer une node pour le modele
     ISceneNode* node = smgr->addEmptySceneNode();

     // Precharge les "mesh/mailles" des modèles (un seul sera affiché dans la node)
     IAnimatedMesh* currentModel_mesh = smgr->getMesh("referenceMDL.x");
     IAnimatedMesh* currentModel_idlemesh = smgr->getMesh("idleAnimation.x");

     // Créer une node animée utilisant le mesh de référence
     IAnimatedMeshSceneNode* currentModel_node = smgr->addAnimatedMeshSceneNode(currentModel_mesh,node);

     // Assigne l'animation "idle" au modèle.
     ISkinnedMesh* skin = (ISkinnedMesh*)currentModel_mesh;
     ISkinnedMesh* skinidle = (ISkinnedMesh*)currentModel_idlemesh;
     skin->useAnimationFrom(skinidle);

J'ai précédemment chargé les 2 fichiers (currentModel.mesh et currentModel.idlemesh) qui sont des IAnimatedMesh convertis en ISkinnedMesh.