Tout les formats géré par irrlicht supportent a merveille l'animation.
par contre, le .b3d, le ms3d, e .x et quelques autres ne gèrent que l'animation bones.
pour animer un objet tu fait :

node->setFrameLoop(0, 10);

le premier paramètre correspond a la première frame de ton animation et le deuxième paramètre a la dernière frame de ton animation.
Sinon, si tu veut animer des .md2, tu a setMD2Animation() je crois et tu a l'équivalent pour les .md3.