En fait c'est la méthode d'orientation des trois axes dans l'espace, main droite ou main gauche.
Cela se traduit sur le calcul de la matrice comme suit si mes souvenirs sont bon:

2/w 0 0 0
0 2/h 0 0
0 0 1/zNear-zFar) 0
0 0 zNear/(zNear-zFar) 1

pour une orientation main droite, et pour une orientation main
gauche comme suit:

2/w 0 0 0
0 2/h 0 0
0 0 1/zFar-zNear) 0
0 0 zNear/(zNear-zFar) 1

Voilà.